Иҷрои чаҳор таҳлили тақвияти кислотаи нуклеинӣ барои муайян кардани SARS-CoV-2 дар Эфиопия

Ташаккур ба шумо барои боздид аз Nature.com. Шумо версияи браузерро бо дастгирии маҳдуди CSS истифода мебаред. Барои таҷрибаи беҳтарин, мо тавсия медиҳем, ки шумо браузери навшударо истифода баред (ё Ҳолати мутобиқатро дар Internet Explorer хомӯш кунед). Илова бар ин, барои таъмини дастгирии доимӣ, мо сайтро бе услубҳо ва JavaScript нишон медиҳем.
Якбора карусели се слайдро намоиш медиҳад. Тугмаҳои Пешина ва Ояндаро истифода баред, то дар як вақт дар се слайд гузаред ё тугмаҳои слайдерро дар охир истифода баред, то дар як вақт аз се слайд гузаред.
Аз замони сар задани бемории коронавирус дар соли 2019 (COVID-19) дар саросари ҷаҳон бисёр озмоишҳои тиҷоратии амплификацияи кислотаи нуклеинӣ (NAATs) таҳия карда шуданд ва ба таҳлилҳои стандартӣ табдил ёфтанд. Гарчанде ки якчанд санҷишҳо зуд таҳия ва ба озмоишҳои ташхиси лабораторӣ татбиқ карда шуданд, иҷрои ин санҷишҳо дар танзимоти гуногун арзёбӣ карда нашудаанд. Аз ин рӯ, ҳадафи ин тадқиқот арзёбии иҷрои таҳлилҳои Abbott SARS-CoV-2, Daan Gene, BGI ва Sansure Biotech бо истифода аз стандарти Composite Reference Standard (CRS) буд. Тадқиқот дар Институти тандурустии ҷамъиятии Эфиопия (EPHI) аз 1 то 30 декабри соли 2020 гузаронида шуд. Бо истифода аз маҷмӯаи хурди QIAamp RNA ва системаи омодасозии намунаи Абботт ДНК 164 намунаи бинӣ гирифта шуд. Аз 164 намуна, 59,1% мусбат ва 40,9% манфӣ барои CRS буданд. Positivity Sansure Biotech дар муқоиса бо CRS хеле паст буд (p <0.05). Positivity Sansure Biotech дар муқоиса бо CRS хеле паст буд (p <0.05). Положительные результати Sansure Biotech аз ҷониби CRS (p < 0,05) ҳеҷ чиз нест. Натиҷаҳои мусбии Sansure Biotech дар муқоиса бо CRS (p <0.05) хеле пасттар буданд.与CRS 相比，Sansure Biotech 的阳性率显着较低（p <0,05）。与CRS 相比，Sansure Biotech 的阳性率显着较低（p <0,05）。 U Sansure Biotech дар CRS (p < 0,05) дар бораи натиҷаҳои мусбӣ маълум аст. Sansure Biotech дар муқоиса бо CRS (p <0.05) натиҷаҳои мусбати хеле камтар дошт.Муносибати умумии чаҳор таҳлил дар муқоиса бо CRS 96,3-100% буд. Илова ба сатҳи пасти мусбати таҳлили Sansure Biotech, иҷрои чаҳор таҳлил тақрибан қобили муқоиса буд. Ҳамин тариқ, таҳлили Sansure Biotech [Research Only (RUO)] барои истифодаи он дар Эфиопия тасдиқи иловагиро талаб мекунад. Ниҳоят, тадқиқоти иловагӣ бояд барои арзёбии таҳлилҳо бо даъвоҳои мувофиқи истеҳсолкунанда баррасӣ карда шавад.
Озмоиши лабораторӣ қисми Нақшаи стратегии Созмони умумиҷаҳонии тандурустӣ (ТУТ) оид ба бемории коронавирус 2019 (COVID-19) омодагӣ ва вокуниш (SPRP) мебошад. ТУТ маслиҳат медиҳад, ки кишварҳо бояд зарфияти лабораториро барои беҳтар кардани омодагӣ, идоракунии дурусти ҳолатҳо, ҳушёрӣ ва вокуниши сареъ ба мушкилоти саломатии аҳолӣ эҷод кунанд. Ин аз он шаҳодат медиҳад, ки нақши лаборатория барои тавсифи беморӣ ва эпидемиологияи пайдоиши агентҳои сирояткунанда ва назорати паҳншавии онҳо муҳим аст.
Ташхиси COVID-19 маълумоти эпидемиологӣ ва тиббӣ, аломатҳо/аломатҳои шахсӣ ва маълумоти рентгенӣ ва лабораториро талаб мекунад2. Пас аз он ки хуруҷи COVID-19 дар Вуҳани Чин гузориш дода шуд, дар саросари ҷаҳон бисёр санҷишҳои амплификацияи кислотаи нуклеинӣ (NAATs) таҳия карда шуданд. Реаксияи занҷири полимеразии транскрипсияи баръакс (rRT-PCR) ҳамчун усули муқаррарӣ ва стандартӣ барои ташхиси лаборатории синдроми шадиди роҳи нафас 2 (SARS-CoV-2)3 истифода шудааст. Муайянкунии молекулавии SARS-CoV-2 маъмулан ба генҳои N (гени сафедаи нуклеокапсид), E (гени сафедаи лифофа) ва RdRp (гени РНК-полимераза вобаста) дар ORF1a/b (чаҳорчӯбаи хониши кушодаи 1a/b) асос меёбад. . ген) минтақае, ки аз геноми вирус муайян карда шудааст. Онҳо минтақаҳои асосии ҳифзшуда ҳисобида мешаванд, ки дар геномҳои вирусӣ барои шинохти вирус мавҷуданд4. Дар байни ин генҳо генҳои RdRp ва E ҳассосияти баланди ташхиси таҳлилӣ доранд, дар ҳоле ки гени N ҳассосияти пасти таҳлилӣ дорад5.
Иҷрои таҳлилҳои ПТР вобаста ба омилҳои гуногун метавонад фарқ кунад, масалан: реагентҳои экстраксия, реагентҳои амплификация/детектор, усули истихроҷ, сифати мошини ПТР ва асбобҳои дигар. То моҳи апрели соли 2020 беш аз 48 дастгоҳи ташхисии гуногун аз нӯҳ кишвар барои ташхиси COVID-196 Иҷозати истифодаи изтирорӣ (EUA) гирифтаанд. Дар Эфиопия зиёда аз 14 платформаи PCR дар вақти воқеӣ барои муайян кардани PCR-и SARS-CoV-2 дар 26 муассисаи тандурустии давлатӣ, аз ҷумла ABI 7500, Abbott m2000, Roche 48000 ва Quant-studio7 истифода мешаванд. Илова бар ин, маҷмӯаҳои гуногуни санҷиши ПТР мавҷуданд, ба монанди санҷиши Даан Ген, санҷиши Abbott SARS-CoV-2, санҷиши Sansure Biotech ва санҷиши SARS-CoV-2 BGI. Гарчанде ки rRT-PCR хеле ҳассос аст, баъзе беморони гирифтори COVID-19 аз натиҷаи нокифояи нусхаҳои кислотаи рибонуклеинҳои вирусӣ (РНК) дар намунаҳо аз сабаби ҷамъоварӣ, интиқол, нигоҳдорӣ ва коркард ва санҷиши лабораторӣ дар бораи натиҷаҳои бардурӯғи манфӣ гузориш медиҳанд. шароит ва амалиёти кормандон8. Илова бар ин, коркарди нодурусти намуна ё назорат, танзими ҳадди давра (Ct) ва реактивии байниҳамдигарӣ бо дигар кислотаҳои нуклеинҳои патогенӣ ё РНК-и ғайрифаъол/боқимондаи SARS-CoV-2 метавонад дар таҳлилҳои rRT-PCR9 ба натиҷаҳои мусбати бардурӯғ оварда расонад. Ҳамин тариқ, маълум аст, ки санҷишҳои ПТР воқеан ҳам интиқолдиҳандагони порчаҳои генҳоро муайян карда метавонанд, зеро онҳо ҳатто байни генҳои воқеии вирусии вирусро фарқ карда наметавонанд, бинобар ин санҷишҳо танҳо интиқолдиҳандагонро муайян карда метавонанд, на беморон10. Аз ин рӯ, муҳим аст, ки баҳодиҳии самаранокии ташхис бо истифода аз усулҳои стандартӣ дар шароити мо. Гарчанде ки бисёре аз реагентҳои NAAT дар Институти тандурустии ҷамъиятии Эфиопия (EPHI) ва дар саросари кишвар дастрасанд, то ҳол арзёбии муқоисавии самаранокии онҳо гузориш дода нашудааст. Аз ин рӯ, ин тадқиқот баҳодиҳии самаранокии муқоисавии маҷмӯаҳои дар тиҷорат дастрас барои ошкор кардани SARS-CoV-2 тавассути rRT-PCR бо истифода аз намунаҳои клиникӣ буд.
Дар ин таҳқиқот ҳамагӣ 164 иштирокчӣ бо гумони COVID-19 дохил карда шуданд. Аксарияти намунаҳо аз марказҳои табобатӣ буданд (118/164 = 72%), дар ҳоле ки 46 нафари боқимонда (28%) аз марказҳои табобатнашуда буданд. Дар байни иштирокчиёне, ки дар марказ табобат нагирифтаанд, 15 (9,1%) ҳолатҳои аз ҷиҳати клиникӣ гумонбаршуда ва 31 (18,9%) дар тамос бо ҳолатҳои тасдиқшуда буданд. Наваду се (56,7%) иштирокчиён мард буданд ва синну соли миёнаи иштирокчиён (± SD) 31,10 (± 11,82) сол буд.
Дар ин таҳқиқот, меъёрҳои мусбат ва манфии чаҳор санҷиш барои COVID-19 муайян карда шуданд. Ҳамин тариқ, сатҳи мусбати таҳлили Abbott SARS-CoV-2, Daan Gene 2019-nCoV, SARS-CoV-2 BGI ва Sansure Biotech 2019-nCoV мутаносибан 59,1%, 58,5%, 57,9% ва 55,5% буд. . Холҳои мусбӣ ва манфии стандарти истинод (CRS) мутаносибан 97 (59,1%) ва 67 (40,9%) буд (Ҷадвали 1). Дар ин тадқиқот, таърифи CRS ба қоидаи "ҳар як мусбат" асос ёфтааст, ки дар он аз чаҳор натиҷаи санҷиш ду ё зиёда натиҷаҳои санҷиш, ки як натиҷаро додаанд, мусбат ё манфӣ ҳисобида мешаванд.
Дар ин таҳқиқот, мо барои ҳама таҳлилҳо дар муқоиса бо CRS 100% (95% CI 94,6–100) созишномаи фоизии манфиро (NPA) пайдо кардем. Таҳлили Sansure Biotechnology ҳадди ақали PPA-ро 93,8% (95% CI 87,2-97,1) нишон дод ва таҳлили Daan Gene 2019-nCoV мувофиқати умумии 99,4% (95% CI 96,6-99,9) дошт. Баръакс, мувофиқати умумӣ байни таҳлили SARS-CoV-2 BGI ва санҷиши Sansure Biotech 2019-nCoV мутаносибан 98,8% ва 96,3% буд (Ҷадвали 2).
Коэффисиенти мувофиқати каппаи Коэн байни натиҷаҳои таҳлили CRS ва Abbott SARS-CoV-2 комилан мувофиқ буданд (K = 1.00). Ба ҳамин монанд, арзишҳои каппаи Коэн, ки аз ҷониби Daan Gene 2019-nCoV, SARS-CoV-2 BGI ва Sansure Biotech 2019-nCoV муайян шудаанд, инчунин ба CRS (K ≥ 0,925) комилан мувофиқанд. Дар ин таҳлили муқоисавӣ, санҷиши хи-мураббаъ (санҷиши McNemar) нишон дод, ки натиҷаҳои санҷиши Sansure Biotech 2019-nCoV аз натиҷаҳои CRS (p = 0,031) ба таври назаррас фарқ мекунанд (Ҷадвали 2).
Тавре ки дар расми нишон дода шудааст.1 фоизи пасттарин арзиши Ct (< 20 Ct) аз Абботт SARS-CoV-2 (гени якҷояи RdRp ва N) 87,6% ва ORF1a/b гени Ct аз таҳлили Sansure Biotech 2019-nCoV нишон дод, ки фоизи пасти Арзиши Ct (<20 Ct) 50,3% ва арзиши баланди Ct буд (36-40 Ct) 3,2% буд. 1 фоизи пасттарин арзиши Ct (< 20 Ct) аз Абботт SARS-CoV-2 (гени якҷояи RdRp ва N) 87,6% ва ORF1a/b гени Ct аз таҳлили Sansure Biotech 2019-nCoV нишон дод, ки фоизи пасти Арзиши Ct (<20 Ct) 50,3% ва арзиши баланди Ct буд (36-40 Ct) 3,2% буд.Тавре ки дар расми нишон дода шудааст.1, фоизи нишондоди Ct (< 20 Ct) таҳлили Abbott SARS-CoV-2 (комбинированный ген RdRp и N) 87,6% ҷамъоварӣ мекунад, як ташхиси Ct гена ORF1a/b таҳлили Sansure Biotech 2019-nCoV-ро паст мекунад. (<20 Ct) ҷамъоварӣ 50,3%, дар сатҳи баланд Ct (36-40 Ct) 3,2%. 1, фоизи пасттарин арзиши Ct (< 20 Ct) таҳлили Abbott SARS-CoV-2 (гени якҷояи RdRp ва N) 87,6% буд ва арзиши Ct таҳлили гении ORF1a/b аз Sansure Biotech 2019-nCoV нишон дод ки фоизи арзиши пасти Ct (< 20 Ct) 50,3 фоиз ва арзиши баландро ташкил дод. Ct (36-40 Ct) 3,2% -ро ташкил дод.如图1 所示，Abbott SARS-CoV-2 检测（结合RdRp 和N 基因）的最低Ct 值百分比（（） 60% Biotech. 2019-nCoV 检测的ORF1a/b 基因Ct 值显示低Ct 值(< 20 Ct) 的百分比为50,3%，高Ct 值0Ct(36)的百分比为3,2%。 Тавре ки дар расми 1 нишон дода шудааст, фоизи пасттарини арзиши Ct (< 20 Ct) санҷиши Абботт SARS-CoV-2 (омехтани гени RdRp ва N) 87,6% аст, арзиши гени ORF1a/b Ct санҷиши Sansure Biotech 2019-nCoV паст нишон медиҳад Ct值(<20 Ct) 的 фоиз 50,3% аст,高Ct 值(36–40 Ct) 的 фоиз 3,2% аст. Как показано дар рисунке 1, таҳлили Abbott SARS-CoV-2 (сочетающий гени RdRp и N) дар ҳаҷми 87,6% Ct (< 20 Ct) дар ҳаҷми 87,6%, як ташхиси Ct гена ORF1a/b Biotech201s - Анализ nCoV показал низкий Ct. Тавре ки дар расми 1 нишон дода шудааст, таҳлили Эбботт SARS-CoV-2 (бо омезиши генҳои RdRp ва N) фоизи пасттарин арзиши Ct (<20 Ct) дар 87,6% дошт, дар ҳоле ки арзиши Ct гени ORF1a/b дар Sansure Таҳқиқоти Biotech 2019 - Таҳлили nCoV Ct-и пастро нишон дод. Проценти значений (< 20 Ct) 50,3 фоиз, як фоизи зичии баланд Ct (36-40 Ct) 3,2 фоизро ташкил дод. Фоизи арзишҳо (<20 Ct) 50,3% ва фоизи арзишҳои баланди Ct (36-40 Ct) 3,2% буд.Санҷиши Abbott SARS-CoV-2 B арзишҳои Ct-ро аз 30 боло сабт кардааст. Аз тарафи дигар, дар таҳлили BGI SARS-CoV-2 гени ORF1a/b арзиши баланди Ct (> 36 Ct) 4% буд (расми 1). Аз тарафи дигар, дар таҳлили BGI SARS-CoV-2 гени ORF1a/b арзиши баланди Ct (> 36 Ct) 4% буд (расми 1). С стороны, в анализе BGI SARS-CoV-2 ген ORF1a/b имел возеҳ значение Ct (> 36 Ct), фоизи коҳиши 4% (рис. 1). Аз тарафи дигар, дар таҳлили BGI SARS-CoV-2 ген ORF1a/b дорои арзиши баланди Ct (> 36 Ct) буд, ки фоизи он 4% буд (расми 1).另一方面，在BGI SARS-CoV-2 检测中，ORF1a/b 基因具有高Ct 值（> 36 Ct）的百分比）的百分比%（4（分比） Аз тарафи дигар, дар муайянкунии BGI SARS-CoV-2, фоизи гени ORF1a/b бо арзиши баланди Ct (>36 Ct) 4% аст (Расми 1). Барои таҳлили BGI SARS-CoV-2 фоизи генови ORF1a/b бо миқдори муайяни Ct (>36 Ct) 4% (рис. 1) мебошад. Аз тарафи дигар, дар таҳлили BGI SARS-CoV-2, фоизи генҳои ORF1a/b бо арзишҳои баланди Ct (>36 Ct) 4% буд (расми 1).
Дар ин тадқиқот мо 164 намунаи биниро гирифтем. Барои ҳама намуди таҳлилҳо ҷудокунии РНК ва амплификация бо истифода аз усулҳо ва маҷмӯаҳое, ки аз ҷониби истеҳсолкунандагони мувофиқ тавсия шудаанд, анҷом дода шуданд.
Ин тадқиқот нишон дод, ки озмоиши Эбботт барои SARS-CoV-2 дорои нишондиҳандаи муайянкунии CRS мебошад, ки 100% мусбат, манфӣ ва мувофиқати умумӣ дорад. Созишномаи каппа Коэн 1.00 аст, ки бо CRS мувофиқати пурраро нишон медиҳад. Тадқиқоти шабеҳи Донишгоҳи Вашингтон дар ИМА нишон дод, ки ҳассосият ва хосияти санҷиши Abbott барои SARS-CoV-2 мутаносибан 93% ва 100% дар муқоиса бо таҳлили лабораторӣ (LDA) CDC мебошад. . 11. Системаи ташхиси Эбботт SARS-CoV-2 ба ошкоркунии якҷояи генҳои N ва RdRp асос ёфтааст, зеро ҳарду ген ҳассостар буда, манфиҳои бардурӯғро кам мекунанд12. Тадқиқот дар Вена, Австрия инчунин нишон дод, ки ҳаҷми калони намунаи истихроҷ ва ҳаҷми элюентҳои муайянкунанда таъсири ҳалкунандаро кам карда, самаранокии ошкоркуниро баланд бардоштанд13. Ҳамин тариқ, мувофиқати комили Эббот барои таҳлили SARS-CoV-2 метавонад бо системаи муайянкунии платформа алоқаманд бошад, ки ҳамзамон генҳои комбинаториро ошкор мекунад, миқдори зиёди намунаҳоро (0,5 мл) истихроҷ мекунад ва миқдори зиёди элюентро (40 мкл) истифода мебарад.
Натиҷаҳои мо инчунин нишон доданд, ки иҷрои ташхиси санҷиши генетикии Даан тақрибан бо CRS якхела буд. Ин ба тадқиқот14, ки дар Донишгоҳи Анҳуи дар Ҳуайнани Чин гузаронида шудааст ва даъвои истеҳсолкунанда дар бораи 100% мувофиқати мусбӣ мувофиқ аст. Сарфи назар аз гузоришҳо дар бораи натиҷаҳои пайваста, як намуна пас аз санҷиши такрории ҳамон элюат манфии бардурӯғ буд, аммо дар таҳлилҳои Abbott SARS-CoV-2 ва Sansure Biotech nCoV-2019 мусбат буд. Ин аз он шаҳодат медиҳад, ки метавонанд дар натиҷаҳо дар намудҳои гуногуни таҳлилҳо гуногун бошанд. Бо вуҷуди ин, дар тадқиқоте, ки дар Чин гузаронида шуд15, натиҷаи таҳлили Даан Ген дар муқоиса бо таҳлили истинодҳои дар лаборатория муайяншуда ба таври назаррас фарқ дошт (p <0,05). Бо вуҷуди ин, дар тадқиқоте, ки дар Чин гузаронида шуд15, натиҷаи таҳлили Даан Ген дар муқоиса бо таҳлили истинодҳои дар лаборатория муайяншуда ба таври назаррас фарқ дошт (p <0,05). Тем не менее, в исследовании, проведенном в Китае15, результат анализа Daan Gene значительно отличалься (p < 0,05) аз их лабораторного эталонного анализа. Аммо, дар як тадқиқот дар Чин15, натиҷаи таҳлили Даан Ген аз таҳлили истинодҳои лаборатории онҳо ба таври назаррас фарқ дошт (p <0,05).然而，在中国进行的研究中15，大安基因检测的结果与其实验室定义的参考检测相比有显着差异（p <0,05）.然而，在中国进行的研究中15，大安基因检测的结果与其实验室定义的参考检测相比有显着差<0,05 Однако в исследовании, проведенном дар Китае15, результаты генетического теста Daan значительно отличались (p < 0,05) по сравнению с его эталонным лабораторным тестом. Аммо, дар як тадқиқот дар Чин15, натиҷаҳои санҷиши генетикии Даан дар муқоиса бо санҷиши лаборатории истинод ба таври назаррас фарқ карданд (p <0,05).Ин ихтилоф метавонад аз ҳассосияти санҷиши истинод барои ошкор кардани SARS-CoV-2 бошад ва таҳқиқоти минбаъда барои муайян кардани сабаб муҳиманд.
Илова бар ин, таҳқиқоти мо иҷрои муқоисавии таҳлили SARS-CoV-2 BGI бо CRS арзёбӣ карда, мувофиқати аълои фоизи мусбат (PPA = 97,9%), мувофиқати фоизи манфӣ (NPA = 100%) ва мувофиқати умумии фоизро аз рӯи ҷинс ( OPA). ). = 98,8%). Арзишҳои Каппа Коэн мувофиқати хуб нишон доданд (K = 0.975). Таҳқиқот дар Нидерландия16 ва Чин15 натиҷаҳои пайваста нишон доданд. Санҷиши SARS-CoV-2 BGI санҷиши як ген (ORF1a/b) бо истифода аз элюати 10 мкл амплификация/айфкунанда мебошад. Сарфи назар аз мувофиқати хуби оморӣ бо натиҷаҳои истинодҳои мо, таҳлил ду намунаи мусбӣ (1,22%) аз умумии интихобро аз даст дод. Ин метавонад барои динамикаи интиқол ҳам дар сатҳи беморон ва ҳам дар ҷомеа таъсири бузурги клиникӣ дошта бошад.
Таҳлили дигари муқоисавӣ, ки ба ин тадқиқот дохил карда шудааст, санҷиши Sansure Biotech nCoV-2019 rRT-PCR (RUO) буд; фоизи умумии бозии 96,3 фоизро ташкил дод. Қувваи созишнома инчунин аз ҷониби арзиши Каппаи Коэн муайян карда шуд, ки 0,925 буд, ки бо CRS мувофиқати пурраро нишон медиҳад. Боз ҳам, натиҷаҳои мо бо таҳқиқоте, ки дар Донишгоҳи марказии ҷанубии Чаншаи Чин ва дар шӯъбаи лабораторияи клиникии Беморхонаи мардумии Лючжоу, шаҳри Лючжоуи Чин гузаронида шудаанд, шабеҳанд. Гарчанде ки мувофиқати омории дар боло зикршуда ба қайд гирифта шуда бошад ҳам, санҷиши хи-мураббаъ (санҷиши MacNemar) нишон дод, ки натиҷаи санҷиши Sansure Biotech дар муқоиса бо CRS фарқияти аз ҷиҳати оморӣ муҳим дорад (p <0.005). Гарчанде ки мувофиқати омории дар боло зикршуда ба қайд гирифта шуда бошад ҳам, санҷиши хи-мураббаъ (санҷиши MacNemar) нишон дод, ки натиҷаи санҷиши Sansure Biotech дар муқоиса бо CRS фарқияти аз ҷиҳати оморӣ муҳим дорад (p <0.005). Несмотря на то, что било зафиксировано указанное выше хорошее статистическое соответствие, таҳлили хи-квадрат (критерий Макнемара) показал, дар натиҷаи таҳлили Sansure Biotech статистически различие различие с, сравненно CRS (сравнен <005). Гарчанде ки созишномаи хуби оморӣ дар боло сабт шудааст, санҷиши хи-мураббаъ (санҷиши МакНемар) нишон дод, ки натиҷаи санҷиши Sansure Biotech дар муқоиса бо CRS фарқияти аз ҷиҳати оморӣ муҳим дорад (p <0.005).尽管记录了上述良好的统计一致性，但卡方检验（MacNemar 检验）表明，Sansure Biotech）表明，Sansure Biotech相比具有统计学显着差异（p < 0,005）。尽管 记录 了 上述 良好 统计 一致性 ， 但 检验 （（macnemar 检验 表明 朣田 朣朣朣朣 ＀验 biotech ，与 crs 相比 具有 显着 （（(p <0,005。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。. Несмотря на отмеченное выше хорошее статистическое соответствие, параметр хи-квадрат (критерий Макнемара) показал статистические значимую разницу (p < 0,005) байни таҳлилҳо Sansure Biotech и CRS. Сарфи назар аз созишномаи хуби омории дар боло зикршуда, санҷиши хи-мураббаъ (санҷиши МакНемар) фарқияти аз ҷиҳати оморӣ муҳимро (p <0.005) байни таҳлили Sansure Biotech ва CRS нишон дод.Шаш намуна (3,66%) дар муқоиса бо CRS манфиҳои бардурӯғ муайян карда шуданд (Ҷадвали иловагӣ 1); ин хеле муҳим аст, махсусан бо назардошти динамикаи интиқоли вирус. Маълумоти дар боло зикршуда низ ин суръати пасти ошкоркуниро дастгирӣ мекунад15.
Дар ин таҳқиқот, арзишҳои Ct барои ҳар як таҳлил ва платформаи мувофиқ муайян карда шуданд, ки арзиши пасттарини Ct дар таҳлили Abbott SARS-CoV-2 гузориш дода шудааст. Ин натиҷа метавонад бо системаи ҳамзамон санҷиши генетикии Эббот барои ошкор кардани SARS-CoV-2 алоқаманд бошад. Аз ин рӯ, тибқи расми 1, 87,6% натиҷаҳои Abbott SARS-CoV-2 арзиши Ct аз 20 камтар буданд. Танҳо шумораи ками натиҷаҳои интихоб (12,4%) дар диапазони 20-30 буданд. Қиматҳои Ct аз 30 боло ба қайд гирифта нашудаанд. Илова ба истифодаи Эббот аз формати санҷиши генетикии панели SARS-CoV-2, ин натиҷа метавонад ба маҳдудияти поёнии муайянкунӣ (32,5 нусхаи РНК/мл)18 алоқаманд бошад, ки аз маҳдудияти поёнии ширкат 100 нусхаи РНК се маротиба камтар аст. /мл. мл) 19.
Ин тадқиқот баъзе маҳдудиятҳо дорад: аввалан, мо аз сабаби набудани захираҳо усулҳои стандартӣ / истинод [ба монанди сарбории вирусӣ ё дигар озмоишҳои лабораторӣ (LDA)] надорем. Дуюм, ҳама намунаҳое, ки дар ин таҳқиқот истифода шудаанд, тампонҳои бинии ҳалқум буданд, дар ҳоле ки натиҷаҳо ба дигар намудҳои намунаҳо мувофиқ набуданд ва сеюм, андозаи намунаи мо хурд буд.
Ин тадқиқот иҷрои чаҳор таҳлили rRT-PCR барои SARS-CoV-2 бо истифода аз намунаҳои бинии ҳалқро муқоиса кард. Ҳама таҳлилҳои ошкоркунӣ, ба истиснои таҳлили Sansure Biotech, иҷрои қариб қобили муқоиса буданд. Ғайр аз он, сатҳи пасти мусбат дар таҳлили Sansure Biotech дар муқоиса бо CRS муайян карда шуд (p <0,05). Ғайр аз он, сатҳи пасти мусбат дар таҳлили Sansure Biotech дар муқоиса бо CRS муайян карда шуд (p <0,05). Кроме того, дар санҷиши Sansure Biotech бо як фоизи пасти натиҷаҳо дар CRS (p < 0,05). Илова бар ин, санҷиши Sansure Biotech фоизи пасти натиҷаҳои мусбатро дар муқоиса бо CRS нишон дод (p <0,05).此外，与CRS 相比，Sansure Biotech 检测的阳性率较低(p <0.05)。此外，与CRS 相比，Sansure Biotech 检测的阳性率较低(p <0.05)。 Кроме того, таҳлили Sansure Biotech имел более низкий уровень натиҷаҳои положительных барои сравнению дар CRS (p < 0,05). Илова бар ин, санҷиши Sansure Biotech сатҳи мусбатро нисбат ба CRS камтар дошт (p <0,05).Таҳлили Sansure Biotech nCoV-2019 (RUO) аз PPA, NPA ва созишномаи умумӣ аз 93,5% зиёд буд ва қувваи Коэн Каппа арзиши созишномаи 0,925 буд. Ниҳоят, Sansure Biotech Assay (RUO) барои истифода дар Эфиопия ба тасдиқи минбаъда ниёз дорад ва барои арзёбии даъвоҳои истеҳсолкунандагони инфиродӣ тадқиқоти иловагӣ бояд баррасӣ карда шавад.
Тарҳрезии тадқиқоти муқоисавӣ дар чаҳор муассисаи тандурустии Аддис-Абеба, беморхонаи Эка Котебе, Маркази табобати калисои Ҳазорсола, беморхонаи ёдбуди Зевудиту ва беморхонаи мутахассиси оид ба бемории сил Петрус гузаронида шуд. Маълумот аз 1 то 31 декабри соли 2020 ҷамъоварӣ шудааст. Муассисаҳои тиббӣ барои ин тадқиқот бо назардошти шумораи зиёди ҳолатҳо ва мавҷудияти марказҳои асосии табобатӣ дар шаҳр ҳадафмандона интихоб карда шуданд. Ба ҳамин монанд, асбобҳо, аз ҷумла асбобҳои PCR дар вақти воқеӣ ABI 7500 ва Abbott m2000, мувофиқи тавсияҳои истеҳсолкунандагони реагентҳои NAAT интихоб карда шуданд ва чаҳор маҷмӯаи муайянкунии PCR барои ин таҳқиқот интихоб карда шуданд, зеро аксари лабораторияҳо дар Эфиопия ҳадди ақалл чор нафарашон. Санҷиши ген, санҷиши Abbott SARS-CoV-2, санҷиши Sansure Biotech ва санҷиши SARS-CoV-2 BGI дар давоми омӯзиш гузаронида шуд).
Санҷиш барои SARS-CoV-2 аз 1 то 30 декабри соли 2020 бо истифода аз 3 мл Medium Viral Transport Medium (VTM) (Miraclean Technology, Шенҷен, Чин) аз ашхоси таҳти тафтиши COVID-19, ки ба EPHI истинод шудааст, гузаронида шуд. Намунаҳои назофарингеалӣ аз ҷониби коллекторҳои омӯзонидашуда ҷамъоварӣ карда шуданд ва ба EPHI дар бастаҳои сегона фиристода шуданд. Пеш аз ҷудо кардани кислотаи нуклеинӣ, ба ҳар як намуна рақами мушаххаси мушаххас дода мешавад. Истихроҷ аз ҳар як намуна фавран пас аз расидан бо истифода аз усулҳои истихроҷи дастӣ ва автоматӣ анҷом дода мешавад. Ҳамин тариқ, барои истихроҷи худкори Abbott m2000, 1,3 мл (аз ҷумла 0,8 мл ҳаҷми мурда ва 0,5 мл ҳаҷми вуруди истихроҷ) намуна аз ҳар як намуна гирифта шуда, аз системаи омодасозии намунаи Abbott DNA (Abbott Molecular Inc. des Plaines, IL, ИМА). ) Маҷмӯаи 96 [92 намуна, ду назорати ошкор ва ду назорати ғайришаблонӣ (NTC)] ба раванди умумии (ҷустуҷӯ ва ошкор) ду даври SARS-CoV-2 (EUA) дар вақти воқеӣ дохил карда шуд. истихроҷи маъдан. Ба ҳамин монанд, барои истихроҷи дастӣ, ҳамон намунаҳоро истифода баред (барои истихроҷи худкор ва кашф). Ҳамин тариқ, дар тӯли ин раванд, 140 мкл намунаҳо бо истифода аз маҷмӯаи QIAamp Viral RNA Mini (QIAGEN GmbH, Hilden, Олмон) дар 24 партия (аз ҷумла 20 намуна, ду назорати таҳлил ва ду NTC) дар тӯли нӯҳ давр ҷудо карда шуданд ва истихроҷ карда шуданд. Элюатҳои дастӣ истихроҷшуда бо истифода аз циклери гармии ABI 7500 бо истифода аз таҳлили SARS-CoV-2 BGI, таҳлили Даан Ген ва таҳлили Sansure Biotech тақвият дода шуданд ва ошкор карда шуданд.
Изолятсияи автоматӣ ва тозакунии РНК вирусии SARS-CoV-2 бо истифода аз реагентҳои омодасозии намунаи ДНК Абботт аз рӯи принсипи маҳтобии магнитӣ амал мекунад. Инактивизатсияи намунаҳо ва ҳаллубилизатсияи зарраҳои вирусӣ бо истифода аз шустушӯйӣ, ки дорои гуанидин изотиоцианат барои денатурат кардани сафеда ва ғайрифаъол кардани RNase анҷом дода мешавад. Пас аз он РНК аз сафеда тавассути ҷудокунии фазаи сахт бо истифода аз кремний ҷудо карда мешавад, яъне намаки гуанидиний ва рН-и ишқории буфери лизис ба пайвастани кислотаҳои нуклеинӣ ба кремний (SiO2) мусоидат мекунад. Қадами шустани сафедаҳо ва хошокҳои боқимонда хориҷ карда мешавад, то маҳлули равшанро ба даст орад. РНК-и шаффоф аз микрозаррачаҳои кремний бо истифода аз майдони магнитии асбоб ҷудо карда мешавад20,21. Аз тарафи дигар, ҷудокунии дастӣ ва тозакунии РНК бо усули сутуни чарх бо истифода аз центрифуга ба ҷои стенди магнитӣ ва ҷудо кардани микрозаррачаҳо аз элюент анҷом дода мешавад.
Санҷиши муайянкунии SARS-CoV-2 дар вақти воқеӣ (Abbott Molecular, Inc.) мувофиқи дастурҳои истеҳсолкунанда анҷом дода шуд, ки EUA19,22 аз ТУТ ва FDA гирифтааст. Дар ин протокол, ғайрифаъолкунии намуна пеш аз истихроҷ дар ванна об дар 56 °C барои 30 дақиқа анҷом дода шуд. Пас аз фаъолсозии вирус, истихроҷи кислотаи нуклеинӣ дар асбоби Abbott m2000 SP аз 0,5 мл VTM бо истифода аз системаи омодасозии намунаи ДНК Abbott m2000 анҷом дода шуд. мувофиқи истеҳсолкунанда. Амплификация ва ошкоркунӣ бо истифода аз асбоби Abbott m2000 RT-PCR анҷом дода шуд ва барои генҳои RdRp ва N муайянкунии дугона анҷом дода шуд. ROX) ва VIC P (рангҳои хусусӣ) барои мақсаднокӣ ва ошкор кардани назорати дохилӣ, имкон медиҳад, ки ҳамзамон ҳамзамон ҳарду маҳсулоти пурқувватро муайян кунанд 19 .
Усули муайянкунии тақвияти ин маҷмӯа ба технологияи як қадами RT-PCR асос ёфтааст. Генҳои ORF1a/b ва N ҳамчун минтақаҳои ҳифзшуда аз ҷониби Daan Gene Technology барои муайян кардани тақвияти минтақаи мавриди ҳадаф интихоб карда шуданд. Праймерҳои мушаххас ва зондҳои флуоресцентӣ (зондҳои гении N бо FAM нишон дода шудаанд, зондҳои ORF1a/b бо VIC нишонгузорӣ шудаанд) барои ошкор кардани SARS-CoV-2 РНК дар намунаҳо тарҳрезӣ шудаанд. Омехтаҳои ниҳоии элюент ва мастер бо илова кардани 5 мкл элюент ба 20 мкл омехтаи мастер ба ҳаҷми ниҳоии 25 мкл омода карда шуданд. Амплификация ва муайянкунӣ дар як вақт дар асбоби воқеии PCR ABI 750024 анҷом дода шуданд.
Генҳои ORF1a/b ва N бо истифода аз маҷмӯаи ташхиси кислотаи нуклеинии Sansure Biotech nCoV-2019 (детекторияи флюоресцентии PCR) ошкор карда шуданд. Бо интихоби канали FAM барои минтақаи ORF1a/b ва канали ROX барои гени N барои ҳар як гени мавриди ҳадаф зондҳои мушаххас омода кунед. Ба ин маҷмӯаи таҳлил, реагентҳои элюент ва омехтаи мастер ба таври зерин илова карда мешаванд: 30 мкл реагенти омехтаи асосӣ ва 20 мкл намунаи элютсияро барои ошкор кардан/амплификация омода кунед. Дар вақти воқеӣ PCR ABI 750025 барои амплификация / ошкор истифода шуд.
Санҷиши SARS-CoV-2 BGI як маҷмӯаи флюоресцентии вақти воқеӣ барои ташхиси COVID-19 rRT-PCR мебошад. Минтақаи ҳадаф дар минтақаи ORF1a/b геноми SARS-CoV-2 ҷойгир аст, ки усули ягонаи муайянкунии ген мебошад. Илова бар ин, гени хонагии инсон β-актин як гени мақсадноки дар дохили танзимшаванда мебошад. Омехтаи асосӣ бо омехта кардани 20 мкл реагенти омехтаи асосӣ ва 10 мкл намунаи истихроҷшудаи РНК дар лавҳаи чоҳ26 омода карда мешавад. Асбоби флюоресцентии ABI 7500 барои пурзӯрсозӣ ва муайянкунии вақт истифода шуд. Ҳама амплификатсияи кислотаи нуклеинӣ, шартҳои иҷроиши PCR барои ҳар як таҳлил ва тафсири натиҷаҳо мувофиқи дастурҳои истеҳсолкунандаи дахлдор анҷом дода шуданд (Ҷадвали 3).
Дар ин таҳлили муқоисавӣ, мо усули стандартии истинодро барои муайян кардани мувофиқати фоизҳо (мусбат, манфӣ ва умумӣ) ва дигар параметрҳои муқоисавӣ барои чор таҳлил истифода набурдем. Ҳар як муқоисаи санҷиш бо CRS анҷом дода шуд, дар ин таҳқиқот CRS аз рӯи қоидаи "ҳар як мусбат" муқаррар карда шуд ва натиҷа муайян карда шуд, на бо як санҷиш, мо ҳадди аққал ду натиҷаи санҷиши мувофиқро истифода кардем. Илова бар ин, дар ҳолати интиқоли COVID-19, натиҷаҳои манфии бардурӯғ назар ба натиҷаҳои мусбати бардурӯғ хатарноктаранд. Аз ин рӯ, барои ҳарчӣ дақиқ гуфтани "мусбат" аз натиҷаи CRS, ҳадди аққал ду санҷиши таҳлил бояд мусбат бошад, яъне ҳадди аққал як натиҷаи мусбӣ аз таҳлили EUA гирифта мешавад. Ҳамин тариқ, аз чор натиҷаи санҷиш, ду ё зиёда натиҷаҳои санҷиш, ки як натиҷа медиҳанд, мусбат ё манфӣ ҳисобида мешаванд18,27.
Маълумот бо истифода аз шаклҳои сохтории истихроҷи додаҳо ҷамъоварӣ карда шуд, ворид ва таҳлили додаҳо бо истифода аз нармафзори омории Excel ва версияи SPSS 23.0 барои омори тавсифӣ анҷом дода шуданд. Муносибати фоизҳои мусбат, манфӣ ва умумӣ таҳлил карда шуданд ва холҳои Kappa барои муайян кардани дараҷаи мувофиқати ҳар як усул бо CRS истифода шуданд. Қиматҳои Каппа чунин шарҳ дода мешаванд: 0,01 то 0,20 барои мувофиқати ҳалим, 0,21 то 0,40 барои мувофиқати умумӣ, 0,41-0,60 барои мувофиқати миёна, 0,61-0,80 барои мувофиқати асосӣ ва 0,81-0,99 барои мувофиқати комил28.
Иҷозати ахлоқӣ аз Донишгоҳи Аддис-Абеба гирифта шудааст ва ҳама протоколҳои таҷрибавӣ барои ин таҳқиқот аз ҷониби Шӯрои баррасии илмии этикаи Институти тандурустии Эфиопия тасдиқ карда шудаанд. Рақами истинод барои Литсензияи этикаи EPHI EPHI/IRB-279-2020 мебошад. Ҳама усулҳо мувофиқи тавсияҳо ва муқаррароти Роҳнамои миллии ҳамаҷонибаи Эфиопия оид ба табобати COVID-19 татбиқ карда шуданд. Илова бар ин, розигии хаттии огоҳшуда аз ҳамаи иштирокчиёни тадқиқот пеш аз иштирок дар тадқиқот гирифта шудааст.
Ҳама маълумоте, ки дар ин таҳқиқот гирифта ё таҳлил карда шудаанд, ба ин мақолаи нашршуда дохил карда шудаанд. Маълумоте, ки натиҷаҳои ин тадқиқотро дастгирӣ мекунанд, аз муаллифи мувофиқ бо дархости асоснок дастрас мебошанд.
Созмони Ҷаҳонии Тандурусти. Тавсияҳо оид ба стратегияҳои озмоиши лабораторӣ барои COVID-19: Роҳнамои муваққатӣ, 21 марти соли 2020 № WHO/2019-nCoV/lab_testing/2020.1 (ТУТ, 2020).
Мулиу, ДС, Пантазопулос, И. & Гургулианис, ташхиси оқилонаи KI COVID-19 дар шӯъбаи ёрии таъҷилӣ: Ҳама дар амал. Мулиу, ДС, Пантазопулос, И. & Гургулианис, ташхиси оқилонаи KI COVID-19 дар шӯъбаи ёрии таъҷилӣ: Ҳама дар амал.Мулиу, ДС, Пантазопулос, И. ва Гургулианис, KI. Ташхиси интеллектуалии COVID-19 дар шӯъбаи ёрии таъҷилӣ: ҳама чиз дар амал.Muliou DS, Pantazopoulos I. and Gurgulyanis KI. Ташхиси интеллектуалии COVID-19 дар шӯъбаҳои ҳолати фавқулодда: ҳамгироии ниҳоӣ дар амал. Мутахассис Реверенд Респира. дорувори. 3, 263–272 (2022).
Митчелл, С.Л. ва Сент Ҷорҷ, К. Арзёбии ташхиси ID NOW EUA. Митчелл, С.Л. ва Сент Ҷорҷ, К. Арзёбии ташхиси ID NOW EUA.Митчелл, С.Л. ва Сент Ҷорҷ, К. Арзёбии ташхиси ID NOW EUA.Митчелл SL ва Сент Ҷорҷ К. Арзёбии ташхиси ID NOW EUA. J. Клиникӣ. Вирус. 128, 104429. https://doi.org/10.1016/j.jcv.2020.104429 (2020).
ТАШКИЛИ ТАНДУРУСТИИ ҶАҲОН. Ташхиси лаборатории бемории коронавирус 2019 (COVID-19) дар бемории гумонбаршудаи инсон. https://www.who.int/publications/i/item/10665-331501 (дастрасшуда 15 августи 2020) (ТУТ, 2020).
Удугама, Б. Ташхиси COVID-19: Бемориҳо ва воситаҳои санҷиш. ACS Nano 14 (4), 3822–3835 (2020).
Сайид С ва дигарон. Таъсиси Коллеҷи патологҳои Африқои Шарқӣ, Марказӣ ва Ҷанубӣ - Мактаби минтақавии патологияи Шарқи Наздик ва Африқои Ҷанубӣ. Африка. J. Лаб. дорувори. 9(1), 1-8 (2020).
Институти тандурустии ҷамъиятии Эфиопия, Вазорати федералии тандурустӣ. Стратегияи муваққатии миллӣ ва роҳнамо оид ба ташхиси лаборатории COVID-19. https://ephi.gov.et/images/novel_coronavirus/EPHI_PHEOC_COVID-19_Laboratory_Diagnosis_Eng.pdf (дастрасшуда 12 августи соли 2020) (EPHI, 2020).
Волошин, С., Пател, Н. & Кесселхайм, AS Санҷишҳои манфии бардурӯғ барои мушкилот ва оқибатҳои сирояти SARS-CoV-2. Волошин, С., Пател, Н. & Кесселхайм, AS Санҷишҳои манфии бардурӯғ барои мушкилот ва оқибатҳои сирояти SARS-CoV-2.Волошин С., Пател Н. ва Кесселхайм AS Санҷишҳои бардурӯғ-манфӣ барои сироятҳои SARS-CoV-2 ва оқибатҳои онҳо.Волошин С., Пател Н. ва Кесселхайм AS Санҷишҳои бардурӯғ-манфӣ барои иғво ва таъсири сирояти SARS-CoV-2. N. eng. J. Тибб. 383 (6), e38 (2020).
Mouliou, DS & Gourgoulianis, KI Ҳолатҳои бардурӯғи мусбат ва бардурӯғ-манфии COVID-19: Стратегияҳои пешгирӣ ва идоракунии роҳи нафас, эмкунӣ ва дурнамои минбаъда. Mouliou, DS & Gourgoulianis, KI Ҳолатҳои бардурӯғи мусбат ва бардурӯғ-манфии COVID-19: Стратегияҳои пешгирӣ ва идоракунии роҳи нафас, эмкунӣ ва дурнамои минбаъда. Mouliou, DS & Gourgoulianis, KI Ложноположительные и ложноотрицательные случаи COVID-19: респираторная профилактика ва стратегияи лечения, вакцинация ва дальнейшие перспективы. Mouliou, DS & Gourgoulianis, KI Ҳодисаҳои мусбати бардурӯғ ва манфии бардурӯғи COVID-19: стратегияҳои пешгирӣ ва табобати роҳи нафас, ваксина ва роҳи пеш.Мулиу, ДС ва Гургулианис, К.И. Ҳодисаҳои бардурӯғи мусбат ва бардурӯғ-манфии COVID-19: стратегияҳо барои пешгирӣ ва табобати роҳи нафас, ваксина ва роҳи пеш. Мутахассис Реверенд Респира. дорувори. 15(8), 993–1002 (2021).
Мулиу, ДС, Иоаннис, П. & Константинос, Г. Ташхиси COVID-19 дар шӯъбаи ёрии таъҷилӣ: Дидани дарахт, вале аз даст додани ҷангал. Мулиу, ДС, Иоаннис, П. & Константинос, Г. Ташхиси COVID-19 дар шӯъбаи ёрии таъҷилӣ: Дидани дарахт, вале аз даст додани ҷангал.Мулиу, ДС, Иоаннис, П. ва Константинос, Г. Ташхиси COVID-19 дар шӯъбаи ёрии таъҷилӣ: Дарахтро бубинед, ҷангалро аз даст диҳед.Мулиу ДС, Иоаннис П. ва Константинос Г. Ташхиси COVID-19 дар утоқҳои ёрии таъҷилӣ: ҷангал барои дарахтон кофӣ нест. Пайдо шудан. дорувори. Ҷ. https://doi.org/10.1136/emermed-2021-212219 (2022).
Дегли-Анжели, Э. Тасдиқ ва тасдиқи иҷрои таҳлилӣ ва клиникии таҳлили Abbott RealTime SARS-CoV-2. J. Клиникӣ. Вирус. 129, 104474. https://doi.org/10.1016/j.jcv.2020.104474 (2020).
Mollaei, HR, Afshar, AA, Kalantar-Neyestanaki, D., Fazlalipur, M. & Aflatoonian, B. Муқоисаи панҷ маҷмӯи ибтидоӣ аз минтақаи геноми гуногуни COVID-19 барои ошкор кардани сирояти вирус тавассути RT-PCR анъанавӣ. Mollaei, HR, Afshar, AA, Kalantar-Neyestanaki, D., Fazlalipur, M. & Aflatoonian, B. Муқоисаи панҷ маҷмӯи ибтидоӣ аз минтақаҳои гуногуни геномии COVID-19 барои ошкор кардани сирояти вирус тавассути RT-PCR анъанавӣ.Mollaei, HR, Afshar, AA, Kalantar-Neyestanaki, D., Fazlipur, M. ва Aflatunyan, B. Муқоисаи панҷ маҷмӯи праймерҳо аз минтақаҳои гуногуни геноми COVID-19 барои ошкор кардани сирояти вирусӣ тавассути RT-PCR анъанавӣ. Моллаей, ХР, Афшар, АА, Калантар-Нейстанаки, Д., Фазлипур, М. & Афлатунян, Б. 比较来自COVID-19不同基因组区域的五个引物组，用于通过常规RT-PCR 检测病毒感染。 Mollaei, HR, Afshar, AA, Kalantar-Neyestanaki, D., Fazlalipur, M. & Aflatoonian, B. Муқоисаи 5 минтақаи гуногуни генетикии COVID-19 барои ошкор кардани сирояти вирусӣ тавассути RT-PCR анъанавӣ.Mollaei HR, Afshar AA, Kalantar-Neyestanaki D, Fazlipur M. and Aflatunyan B. Муқоисаи панҷ маҷмӯи праймерҳо аз минтақаҳои гуногуни геноми COVID-19 барои ошкор кардани сирояти вирусӣ тавассути RT-PCR анъанавӣ.Эрон. J. Микробиология. 12 (3), 185 (2020).
Герцер, I. ва дигарон. Натиҷаҳои пешакии барномаи миллии арзёбии сифат барои ошкор кардани пайдарпаии геномҳои SARS-CoV-2. J. Клиникӣ. Вирус. 129, 104537. https://doi.org/10.1016/j.jcv.2020.104537 (2020).
Ванг, М. ва дигарон. Арзёбии таҳлилии самаранокии панҷ маҷмӯаи RT-PCR барои синдроми шадиди роҳи нафас Coronavirus 2. J. Clinical. лаборатория. анус. 35 (1), e23643 (2021).
Ван Б ва дигарон. Арзёбии ҳафт маҷмӯаи муайянкунии РНК-и SARS-CoV-2 дар Чин дар асоси реаксияи занҷири полимераз дар вақти воқеӣ (PCR). клиникӣ. химиявй. лаборатория. дорувори. 58 (9), e149-e153 (2020).
ван Кастерен, ПБ ва дигарон. Муқоисаи ҳафт маҷмӯаи ташхиси тиҷории RT-PCR COVID-19. J. Клиникӣ. Вирус. 128, 104412 (2020).
Лу, Ю ва дигарон. Муқоисаи иҷрои ташхиси ду маҷмӯаи PCR барои ошкор кардани кислотаҳои нуклеинӣ SARS-CoV-2. J. Клиникӣ. лаборатория. анус. 34 (10), e23554 (2020).
Лефарт, PR ва ғайра. Тадқиқоти муқоисавии чаҳор платформаи санҷиши амплификацияи кислотаи нуклеинӣ (NAAT) SARS-CoV-2 нишон дод, ки иҷрои ID NOW вобаста ба намуди бемор ва намуна ба таври назаррас коҳиш ёфтааст. ташхис. микробиология. Сироят кардан. дисс. 99(1), 115200 (2021).
Молекулаи Эббот. Аббот дар вақти воқеӣ бастаи таҳлили SARS-CoV-2. https://www.molecular.abbott/us/en/products/infectious-disease/RealTime-SARS-CoV-2-Assay. 1-12. (Аз 10 августи соли 2020) (2020).
Клейн, С. Изолятсияи РНК SARS-CoV-2 бо истифода аз маҳтобҳои магнитӣ барои ошкоркунии босуръати миқёси калон аз ҷониби RT-qPCR ва RT-LAMP. Вируси 12(8), 863 (2020).